Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH19Q9H159 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH19Q9H159 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms