Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRTNQ9H040 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRTNQ9H040 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRTNQ9H040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms