Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP1Q9BWH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RPAP1Q9BWH6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP1Q9BWH6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP1Q9BWH6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms