Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS4Q9BT78 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms