Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP3Q9BQQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP3Q9BQQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTP3Q9BQQ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms