Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD180Q99467 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD180Q99467 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD180Q99467 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD180Q99467 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD180Q99467 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD180Q99467 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD180Q99467 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD180Q99467 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD180Q99467 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD180Q99467 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD180Q99467 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD180Q99467 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD180Q99467 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD180Q99467 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD180Q99467 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD180Q99467 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD180Q99467 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD180Q99467 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD180Q99467 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD180Q99467 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms