Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CICQ96RK0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CICQ96RK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CICQ96RK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CICQ96RK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms