Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM74Q96NL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM74Q96NL1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM74Q96NL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM74Q96NL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms