Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFXN2Q96NB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFXN2Q96NB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFXN2Q96NB2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms