Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SFXN2Q96NB2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SFXN2Q96NB2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SFXN2Q96NB2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SFXN2Q96NB2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SFXN2Q96NB2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SFXN2Q96NB2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SFXN2Q96NB2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SFXN2Q96NB2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SFXN2Q96NB2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFXN2Q96NB2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SFXN2Q96NB2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SFXN2Q96NB2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SFXN2Q96NB2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SFXN2Q96NB2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SFXN2Q96NB2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SFXN2Q96NB2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SFXN2Q96NB2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFXN2Q96NB2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFXN2Q96NB2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFXN2Q96NB2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFXN2Q96NB2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SFXN2Q96NB2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFXN2Q96NB2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFXN2Q96NB2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFXN2Q96NB2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFXN2Q96NB2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFXN2Q96NB2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFXN2Q96NB2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFXN2Q96NB2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFXN2Q96NB2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFXN2Q96NB2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFXN2Q96NB2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFXN2Q96NB2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFXN2Q96NB2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFXN2Q96NB2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFXN2Q96NB2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFXN2Q96NB2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFXN2Q96NB2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFXN2Q96NB2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFXN2Q96NB2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFXN2Q96NB2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFXN2Q96NB2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFXN2Q96NB2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFXN2Q96NB2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFXN2Q96NB2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SFXN2Q96NB2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFXN2Q96NB2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFXN2Q96NB2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFXN2Q96NB2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SFXN2Q96NB2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFXN2Q96NB2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFXN2Q96NB2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFXN2Q96NB2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFXN2Q96NB2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFXN2Q96NB2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFXN2Q96NB2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFXN2Q96NB2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFXN2Q96NB2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFXN2Q96NB2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFXN2Q96NB2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFXN2Q96NB2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SFXN2Q96NB2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFXN2Q96NB2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SFXN2Q96NB2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFXN2Q96NB2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFXN2Q96NB2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFXN2Q96NB2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFXN2Q96NB2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFXN2Q96NB2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFXN2Q96NB2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFXN2Q96NB2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFXN2Q96NB2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFXN2Q96NB2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFXN2Q96NB2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFXN2Q96NB2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFXN2Q96NB2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFXN2Q96NB2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFXN2Q96NB2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFXN2Q96NB2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFXN2Q96NB2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFXN2Q96NB2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFXN2Q96NB2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFXN2Q96NB2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFXN2Q96NB2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFXN2Q96NB2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFXN2Q96NB2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFXN2Q96NB2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFXN2Q96NB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFXN2Q96NB2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFXN2Q96NB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFXN2Q96NB2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFXN2Q96NB2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFXN2Q96NB2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms