Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX27Q96L92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX27Q96L92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms