Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMX3Q96JJ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMX3Q96JJ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMX3Q96JJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMX3Q96JJ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms