Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TMX3Q96JJ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TMX3Q96JJ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TMX3Q96JJ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
TMX3Q96JJ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TMX3Q96JJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TMX3Q96JJ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TMX3Q96JJ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TMX3Q96JJ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TMX3Q96JJ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TMX3Q96JJ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMX3Q96JJ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TMX3Q96JJ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TMX3Q96JJ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TMX3Q96JJ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TMX3Q96JJ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TMX3Q96JJ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TMX3Q96JJ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TMX3Q96JJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TMX3Q96JJ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TMX3Q96JJ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMX3Q96JJ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TMX3Q96JJ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TMX3Q96JJ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TMX3Q96JJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TMX3Q96JJ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMX3Q96JJ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TMX3Q96JJ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TMX3Q96JJ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TMX3Q96JJ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TMX3Q96JJ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TMX3Q96JJ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TMX3Q96JJ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TMX3Q96JJ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TMX3Q96JJ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TMX3Q96JJ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMX3Q96JJ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMX3Q96JJ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMX3Q96JJ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMX3Q96JJ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMX3Q96JJ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TMX3Q96JJ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TMX3Q96JJ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMX3Q96JJ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMX3Q96JJ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMX3Q96JJ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TMX3Q96JJ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TMX3Q96JJ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TMX3Q96JJ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TMX3Q96JJ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TMX3Q96JJ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TMX3Q96JJ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TMX3Q96JJ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TMX3Q96JJ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TMX3Q96JJ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TMX3Q96JJ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TMX3Q96JJ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMX3Q96JJ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMX3Q96JJ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMX3Q96JJ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TMX3Q96JJ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMX3Q96JJ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMX3Q96JJ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMX3Q96JJ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMX3Q96JJ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMX3Q96JJ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMX3Q96JJ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TMX3Q96JJ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMX3Q96JJ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMX3Q96JJ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TMX3Q96JJ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TMX3Q96JJ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMX3Q96JJ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TMX3Q96JJ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMX3Q96JJ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TMX3Q96JJ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TMX3Q96JJ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TMX3Q96JJ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMX3Q96JJ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TMX3Q96JJ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TMX3Q96JJ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TMX3Q96JJ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMX3Q96JJ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMX3Q96JJ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TMX3Q96JJ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TMX3Q96JJ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMX3Q96JJ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TMX3Q96JJ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TMX3Q96JJ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TMX3Q96JJ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TMX3Q96JJ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TMX3Q96JJ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TMX3Q96JJ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TMX3Q96JJ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TMX3Q96JJ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TMX3Q96JJ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TMX3Q96JJ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TMX3Q96JJ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TMX3Q96JJ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms