Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAX2Q96IS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAX2Q96IS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms