Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FUBP1Q96AE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FUBP1Q96AE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FUBP1Q96AE4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FUBP1Q96AE4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FUBP1Q96AE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FUBP1Q96AE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms