Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGGTAQ92696 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RABGGTAQ92696 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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