Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDRG1Q92597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDRG1Q92597 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDRG1Q92597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDRG1Q92597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDRG1Q92597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDRG1Q92597 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDRG1Q92597 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms