Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms