Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPCAT1Q8NF37 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPCAT1Q8NF37 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPCAT1Q8NF37 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms