Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
VWDEQ8N2E2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
VWDEQ8N2E2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
VWDEQ8N2E2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VWDEQ8N2E2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms