Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM48Q8IWZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms