Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3BQ8IVW6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3BQ8IVW6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARID3BQ8IVW6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms