Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDZD3Q86UT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD3Q86UT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD3Q86UT5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms