Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM43Q6ZSC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM43Q6ZSC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms