Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NSMFQ6X4W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMFQ6X4W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms