Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASC1Q6TDU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASC1Q6TDU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms