Protein–RNA interactions for Protein: Q6P0N0

MIS18BP1, Mis18-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18BP1Q6P0N0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIS18BP1Q6P0N0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18BP1Q6P0N0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18BP1Q6P0N0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18BP1Q6P0N0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms