Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXNDC8Q6A555 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TXNDC8Q6A555 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms