Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GGNBP1Q5YKI7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GGNBP1Q5YKI7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GGNBP1Q5YKI7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms