Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf60Q5U649 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C12orf60Q5U649 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C12orf60Q5U649 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms