Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT71Q3SY84 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms