Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4Q17RY0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 514.39□□□□□ -0.111e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 514.28□□□□□ -0.121e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-224ENST00000463098 869 ntTSL 213.7□□□□□ -0.221e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 212.77□□□□□ -0.371e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 212.6□□□□□ -0.391e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-207ENST00000412738 1018 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 511.16□□□□□ -0.621e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 510.84□□□□□ -0.671e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 210.76□□□□□ -0.691e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-214ENST00000434927 716 ntTSL 58.35□□□□□ -1.071e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 47.76□□□□□ -1.171e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-238ENST00000493853 567 ntTSL 46.75□□□□□ -1.331e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.491e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.781e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 53.54□□□□□ -1.841e-14■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 516.19■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 313.6□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 11.4
CPEB4Q17RY0 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.511e-323■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 520.79■□□□□ 0.926e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.636e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.516e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.46e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.326e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 516.12■□□□□ 0.176e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 515.58■□□□□ 0.086e-14■□□□□ 11.3
CPEB4Q17RY0 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.989e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.969e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 11.1
CPEB4Q17RY0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 11
CPEB4Q17RY0 ARF5-204ENST00000463733 1509 ntTSL 515.43■□□□□ 0.069e-12■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-12■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 FSCN3-204ENST00000478328 705 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.549e-12■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.064e-18■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 218.54■□□□□ 0.564e-6■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 10.9
CPEB4Q17RY0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-7■□□□□ 10.8
CPEB4Q17RY0 POM121C-207ENST00000614583 4073 ntTSL 212.64□□□□□ -0.394e-7■□□□□ 10.8
CPEB4Q17RY0 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-22■□□□□ 10.7
CPEB4Q17RY0 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 518■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.6
CPEB4Q17RY0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 10.6
CPEB4Q17RY0 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.6
CPEB4Q17RY0 IVNS1ABP-203ENST00000422754 564 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10.6
CPEB4Q17RY0 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.191e-323■□□□□ 10.6
CPEB4Q17RY0 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-8■□□□□ 10.5
CPEB4Q17RY0 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.722e-8■□□□□ 10.5
CPEB4Q17RY0 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)23.94■■□□□ 1.421e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 320.33■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 215.83■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 521.41■■□□□ 1.027e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.177e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 315.91■□□□□ 0.147e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 214.86□□□□□ -0.037e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.767e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 26.79□□□□□ -1.327e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.847e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 53.51□□□□□ -1.857e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.661e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.681e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.881e-8■□□□□ 10.4
CPEB4Q17RY0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.74e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 210.06□□□□□ -0.84e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 26.38□□□□□ -1.394e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 35.74□□□□□ -1.494e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 ANXA1-207ENST00000491192 1400 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.511e-16■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.581e-16■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 25.15□□□□□ -1.594e-7■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.741e-16■□□□□ 10.2
CPEB4Q17RY0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10.1
CPEB4Q17RY0 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 10.1
CPEB4Q17RY0 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.11□□□□□ -1.438e-8■□□□□ 9.9
CPEB4Q17RY0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-7■□□□□ 9.9
CPEB4Q17RY0 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■□□□□ 9.9
Retrieved 100 of 1,751 protein–RNA pairs in 61.1 ms