Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDR2Q16832 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR2Q16832 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR2Q16832 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR2Q16832 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms