Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPPQ16740 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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