Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B3Q16720 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B3Q16720 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B3Q16720 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
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