Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
FOXD1Q16676 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FOXD1Q16676 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD1Q16676 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms