Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACKR1Q16570 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACKR1Q16570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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