Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A2Q13183 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A2Q13183 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A2Q13183 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A2Q13183 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A2Q13183 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms