Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXF1Q12946 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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