Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TWF1Q12792 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWF1Q12792 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TWF1Q12792 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWF1Q12792 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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