Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHRNDQ07001 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNDQ07001 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHRNDQ07001 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNDQ07001 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms