Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRB3Q04118 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRB3Q04118 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRB3Q04118 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRB3Q04118 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRB3Q04118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRB3Q04118 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms