Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP4Q02446 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP4Q02446 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP4Q02446 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP4Q02446 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP4Q02446 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP4Q02446 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP4Q02446 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP4Q02446 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP4Q02446 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP4Q02446 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP4Q02446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP4Q02446 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP4Q02446 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP4Q02446 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP4Q02446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP4Q02446 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP4Q02446 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP4Q02446 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP4Q02446 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP4Q02446 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP4Q02446 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP4Q02446 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP4Q02446 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP4Q02446 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP4Q02446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SP4Q02446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP4Q02446 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP4Q02446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP4Q02446 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP4Q02446 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP4Q02446 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP4Q02446 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP4Q02446 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP4Q02446 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP4Q02446 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP4Q02446 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SP4Q02446 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SP4Q02446 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms