Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLCB3Q01970 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLCB3Q01970 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLCB3Q01970 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLCB3Q01970 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.9 ms