Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MDM2Q00987 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MDM2Q00987 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDM2Q00987 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDM2Q00987 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1905.2 ms