Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPNP63162 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPNP63162 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms