Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP46P62068 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP46P62068 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP46P62068 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP46P62068 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP46P62068 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP46P62068 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP46P62068 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP46P62068 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP46P62068 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP46P62068 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP46P62068 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP46P62068 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP46P62068 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP46P62068 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP46P62068 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP46P62068 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP46P62068 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP46P62068 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP46P62068 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP46P62068 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP46P62068 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP46P62068 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP46P62068 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP46P62068 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP46P62068 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP46P62068 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP46P62068 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP46P62068 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP46P62068 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP46P62068 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP46P62068 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP46P62068 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP46P62068 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms