Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB27AP51159 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB27AP51159 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms