Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP5P45974 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP5P45974 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP5P45974 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP5P45974 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP5P45974 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP5P45974 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP5P45974 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP5P45974 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP5P45974 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP5P45974 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP5P45974 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP5P45974 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP5P45974 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP5P45974 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP5P45974 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP5P45974 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP5P45974 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP5P45974 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP5P45974 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP5P45974 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP5P45974 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP5P45974 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP5P45974 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP5P45974 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP5P45974 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP5P45974 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP5P45974 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP5P45974 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP5P45974 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP5P45974 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP5P45974 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP5P45974 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP5P45974 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP5P45974 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP5P45974 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP5P45974 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP5P45974 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP5P45974 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP5P45974 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP5P45974 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP5P45974 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP5P45974 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP5P45974 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP5P45974 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP5P45974 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP5P45974 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP5P45974 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP5P45974 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP5P45974 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP5P45974 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP5P45974 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP5P45974 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP5P45974 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP5P45974 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP5P45974 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms