Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RDXP35241 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RDXP35241 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDXP35241 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDXP35241 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDXP35241 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDXP35241 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDXP35241 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDXP35241 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDXP35241 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RDXP35241 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDXP35241 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDXP35241 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDXP35241 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDXP35241 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDXP35241 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RDXP35241 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RDXP35241 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDXP35241 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDXP35241 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDXP35241 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDXP35241 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDXP35241 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDXP35241 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDXP35241 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDXP35241 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDXP35241 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDXP35241 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDXP35241 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDXP35241 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDXP35241 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDXP35241 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDXP35241 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDXP35241 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RDXP35241 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RDXP35241 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RDXP35241 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RDXP35241 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDXP35241 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDXP35241 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDXP35241 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDXP35241 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDXP35241 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDXP35241 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms